11月30日前，各省级畜牧兽医主管部门打击违法研制生产经营使用非洲猪瘟疫苗行为进展情况要报送农业农村部畜牧兽医局。按照此前农业农村部通知要求，各地按照相关规范组织鉴别非洲猪瘟疫苗毒，即鉴别基因缺失病毒。那么，基因缺失病毒如何被鉴别？按照相关规范，要进行荧光PCR方法检测，综合判定标准是根据 P72、CD2v、MGF360-505R基因检测结果来判定。P72、CD2v、MGF360-505R分别是什么？
根据文献报道，非洲猪瘟病毒的衣壳主要由病毒编码蛋白P72构成，P72是被感染猪血液中能检测到的主要抗原，CD2v和MGF360-505R是非瘟病毒的毒力基因。如果样品中有非洲猪瘟病毒（包括非瘟流行毒株和基因缺失毒株），用荧光PCR方法检测，样品中P72基因检测结果为阳性，结合 CD2v和MGF360-505R基因检测结果是否为阴性则可判定是哪一种基因缺失株。
通过基因缺失使非洲猪瘟病毒毒力减弱，是非洲猪瘟疫苗研究重要的方向。记者将世界范围内研究人员所研究的主要非瘟基因缺失疫苗进行了整理（如下表）。
从上表可知，研制非洲猪瘟基因缺失疫苗株时，突破口即可缺失的基因有多种选择。那么，如果养殖场使用除缺失CD2v、MGF360-505R之外的疫苗毒株，如何进行检测？
“要推出另外的（除缺失CD2v、MGF360-505R之外的）基因疫苗毒株检测试剂盒才行。”中国工程院院士、华中农业大学教授陈焕春告诉记者，检测另外的基因缺失疫苗须有配套试剂盒，这就需要根据具体缺失的哪个基因来设计相应的疫苗毒株检测试剂盒。
若使用非法非瘟疫苗后一段时间，此时动物体内疫苗毒株已经检测不到，那么则可以检测动物体内的抗体来判断是否使用过疫苗或者是否感染野毒株。非瘟抗体如何检测？陈焕春认为，检测抗体仍需针对基因缺失毒株研发相应的抗体检测试剂盒。
2019年夏季丹麦一家养猪场就出现了一种新的蓝耳病病毒株，新的病毒株波及约35家养猪场，而罪魁祸首就是两种疫苗毒株形成的重组毒株。如果养殖场户非法使用非洲猪瘟基因缺失疫苗，会不会出现非瘟疫苗毒株与野毒株重组或者不同非瘟疫苗毒株之间重组的可能？对此，中国农业大学动物医学院副教授周磊表示有可能。
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