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干货!我国部分地区的北美洲型PRRSV的分离鉴定及重组分析

来源:中农科院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室 2019-08-16 11:21:15| 查看:

  引言
  
  近年来,关于猪繁殖与呼吸综合征病毒 (porcine reproductive and respiratorysyndrome virus, PRRSV)重组的报道较多。重组不仅发生在PRRSV野毒之间[1],还发生在PRRSV野毒与弱毒疫苗株之间[2, 3],这给PRRSV的流行病学监测、疫苗安全以及疫病防控带来了困难。为进一步了解目前我国PRRSV流行及重组情况,本研究对国内2014-2017年来自于黑龙江、河南、辽宁等9个省份的PRRSV阳性临床样品进行了病毒分离。
 
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  材料与方法
  
  本研究取研磨后的组织样品上清液进行稀释,过滤后在MARC-145和PAM细胞上进行病毒分离,共分离到12株北美洲型PRRSV。其中只有1株能感染MARC-145细胞,另外11株只能感染PAM细胞。利用PRRSV全长扩增引物,对12株毒株进行全基因组扩增后,进行序列拼接,全长基因组大小范围为15013-15322nt(不含poly A序列)。其中7株与PRRSV NADC30的核苷酸同源性为92.2-94.8%,5株与PRRSV HuN4的核苷酸同源性为98.7-99.3%。
  
  结果与讨论
  
  利用Simplot软件进行全基因组序列的重组分析。结果发现,7株NADC30-like PRRSV毒株全部发生重组,其中6株PRRSV的重组发生在分支1与分支8之间,1株毒株的重组发生在分支1与分支5之间。5株HP-PRRSV中仅有1株发生重组,其主要亲本为分支8 PRRSV、次要亲本为分支1 PRRSV。这些毒株的分支间重组区域多数定位于非结构蛋白区域。结果表明,北美洲型PRRSV间重组的情况比较复杂,这提示我们需要加强对NADC30-like PRRSV毒株的监测,关注PRRSV重组毒株的传播,制定更加合理的PRRS防控策略。
  
  主要参考文献
  
  [1]Li Bin, Fang Liu-rong, Xu Zuo-fei, et al. Recombination in vaccine and circulatingstrains of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses [J]. EmergInfect Dis, 2009, 15(12): 2032-2035.
  
  [2]Lu Wen-hui, Tun H M, Sun Bao-li, et al. Re-emerging of porcine respiratory andreproductive syndrome virus (lineage 3) and increased pathogenicity aftergenomic recombination with vaccine variant [J]. Vet Microbiol, 2015, 175(2-4):332-340.
  
  [3]Zhao Hua-jian, Han Qing-gong, Zhang Lei, et al. Emergence of mosaic recombinantstrains potentially associated with vaccine JXA1-R and predominant circulatingstrains of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in differentprovinces of China [J]. Virol J, 2017, 14(1): 67.
 

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